Franz nació en 1863 en Weilheim-in-Oberbayern, en la montañosa Múnich, y no tenía un futuro muy prometedor en la Marina Imperial Alemana. Pero después de completar su formación básica en 1879, decidió entrar en la Armada (tal vez para "ver mundo"). Después de estudiar en Kiel, hizo los exámenes de ingreso y, en abril de 1881, a la edad de 18 años, Franz Hipper se convirtió en oficial. Después de otra ronda de estudios, fue nombrado supervisor de instrucción de reclutas para el Primer Batallón Naval. Tras pasar por la Escuela de Oficiales Ejecutivos, en 1885, Hipper serviría en varios buques de guerra, entre ellos la fragata blindada "SMS Friedrich der Grosse" y el acorazado "SMS Worth".
Al ser un modelo de profesionalidad y competencia, Hipper siguió ascendiendo. Convertido en Kapitan zur See en 1907, realizó varios cometidos en alta mar, sirvió como oficial encargado de la formación de tripulaciones de torpederos y, con el tiempo, se convirtió en jefe de gabinete del contralmirante Gustav von Bachmann, comandante en jefe adjunto de las Fuerzas de Reconocimiento. En enero de 1912, cuando ascendieron a von Bachmann, el propio Hipper subió de escalafón y se convirtió a su vez en el contralmirante y comandante en jefe adjunto. En 1913, se puso al frente del Primer Grupo de Exploración, compuesto por cruceros de combate de la Flota de Alta Mar, que combinaban potencia con velocidad.
Estaba en ese puesto cuando estalló ese pequeño follón entre las grandes potencias europeas en agosto de 1914. Durante el resto de su carrera, Franz (ahora "von") Hipper combatiría a los británicos por el control del mar del Norte. Entre los bombardeos a ciudades costeras británicas (Great Yarmouth, Hartlepool, Whitby, etc.) y la participación en las batallas del Banco Dogger y Jutlandia, Franz se mantuvo ocupado durante toda la guerra... Finalmente fue ascendido a comandante de la Flota de Alta Mar en agosto de 1918, pocos meses antes del armisticio. Von Hipper se retiró en diciembre de ese mismo año para llevar una vida tranquila en Altona, donde murió en 1932.