大哥倫比亞在許多地區都出現了衝突。有些時候,玻利瓦會直接向衝突地區展開軍事行動,例如解放委內瑞拉的「輝煌戰役」。但有時共和派(反王室)軍隊卻幾乎在獨立行動,聖地亞哥·馬里諾的情況便是如此。馬里諾原本來自當今委內瑞拉的瑪格麗塔島,曾經嚐試要單槍匹馬從西班牙人手中解放出來這個地區,藉由玻利瓦從西方進軍,馬里諾則從東方進攻委內瑞拉。兩人都聲稱為同一大業而戰,但都拒絕承認對方是主導者。有一個故事說道,馬里諾穿著一身戎裝,對他的隨員吹噓說:「安東尼奧,我年輕、富有、帥氣,還25歲就當上了總司令!我哪還有缺點?」他的助手簡單地回答說:「不夠審慎。」
馬里諾最終不得不讓步,玻利瓦也因此將委內瑞拉的前線指揮權交給了他。兩人繼續並肩作戰,甚至還同時遭到己方將領荷西·里瓦斯逮捕,此人懷有統治大哥倫比亞西部地區的野心。
儘管如此,馬里諾始終沒有忘記委內瑞拉國的夢想。在荷西·安東尼奧·派斯宣佈委內瑞拉獨立後,馬里諾也宣佈了一個獨立的「東方國家」,但很快便遭到推翻,他也被迫逃離,但他堅定的信念卻並未改變——他要發動政變。後來,當派斯的對手掌權並罷免前任領袖時,馬里諾便成為了在戰場上和他兵戎相見並將他擊敗的人。