I vulcani si trovano più spesso in corrispondenza dei confini tra un continente e l'altro. Un vulcano può avere tre stati: dormiente, attivo o in eruzione. I vulcani dormienti sono in tutto e per tutto identici a caselle di montagna. Un vulcano dormiente può diventare attivo: quando questo accade la montagna comincia a brillare dall'interno, mentre il fumo che esce dalla cima rappresenta un indizio degli sviluppi futuri. I vulcani attivi prima o poi eruttano, danneggiando le caselle circostanti con le caratteristiche e i miglioramenti eventualmente presenti.

I miglioramenti danneggiati dall'eruzione di un vulcano possono risultare saccheggiati o rimossi del tutto. Guarnigioni e fortificazioni possono subire danni. I Centri cittadini adiacenti a un vulcano in eruzione possono subire una riduzione della popolazione. Ma non tutto è perduto: in ogni casella coinvolta nell'eruzione è possibile che aumenti la resa di Cibo o Produzione. Le Meraviglie non sono influenzate dalle eruzioni.

Le Fenditure geotermiche sono caratteristiche non rimovibili del terreno che aggiungono +1 Scienza alla casella. L'Acquedotto standard e le Terme romane forniscono +1 Attrattiva quando sono adiacenti a una Fenditura geotermica. Il Bagno termale ungherese fornisce +2 Attrattiva e +3 Turismo. Il miglioramento Centrale geotermica dev'essere obbligatoriamente costruito su una Fenditura geotermica.

In ogni casella adiacente a un fiume si può verificare un'inondazione. Questa può saccheggiare o distruggere i miglioramenti, saccheggiare gli edifici nei distretti, ridurre la popolazione nel Centro cittadino e danneggiare unità e fortificazioni. Le Meraviglie non sono influenzate. Le inondazioni hanno vari gradi di severità: quelle più gravi (come l'Inondazione millenaria) influenzano regioni più vaste. È possibile prevenire le inondazioni costruendo una Diga lungo il corso del fiume (ne può essere costruita soltanto una per fiume). La Meraviglia Grandi bagni non impedisce il verificarsi di inondazioni, ma previene i danni da esse causati. Dopo il passaggio di un'inondazione è possibile che la resa di Cibo o Produzione aumenti nelle caselle coinvolte.

Le Tempeste possono comparire ovunque sulla mappa e hanno una durata di 3 turni. Le tre fasi di una tempesta sono Formazione, Movimento e Dissipazione. Il tipo specifico di tempesta dipende dal terreno circostante. Tutte le tempeste possono causare il saccheggio o la rimozione completa dei miglioramenti nelle caselle, il saccheggio degli edifici nei distretti, la riduzione della popolazione nei Centri cittadini e il danneggiamento delle unità. Gli effetti di una tempesta variano a seconda del tipo:

Le Tormente si possono verificare solo nelle caselle di neve o tundra e possono essere significative (7 caselle) o paralizzanti (19 caselle). Dopo il passaggio di una tormenta è possibile che la resa di Cibo aumenti nelle caselle coinvolte.

Le Tempeste di sabbia si possono verificare solo nelle caselle di deserto e possono essere gradienti (3 caselle) o haboob (7 caselle). Dopo il passaggio di una tempesta di sabbia è possibile che la resa di Cibo o Produzione aumenti nelle caselle coinvolte.

I Tornado si possono verificare solo nelle caselle di prateria e di pianura e possono presentarsi come famiglia (1 casella) o come epidemia (3 caselle).

Gli Uragani si possono verificare solo nelle caselle di oceano e possono essere di Categoria 4 (7 caselle) o di Categoria 5 (19 caselle). Dopo il passaggio di un uragano è possibile che la resa di Cibo o Produzione aumenti nelle caselle coinvolte.

Al procedere della partita attraverso le epoche, le civiltà scopriranno l'Energia e le risorse consumabili. Usare le risorse consumabili per ottenere Energia provocherà un'emissione di CO2. Al crescere della quantità di CO2 prodotta i ghiacci polari cominceranno a sciogliersi, causando l'innalzamento del livello dei mari.

Il terreno sulla costa è suddiviso in quattro livelli:
1 metro
2 metri
3 metri
Non influenzato dall'allagamento delle coste.

Ogni livello di CO2 globale raggiunto alza il livello del mare di 0,5 metri. Questo significa che al livello 2 i territori sulla costa alti 1 metro saranno allagati. Se viene raggiunto un livello abbastanza alto, le caselle alte 1 e 2 metri saranno sommerse e diventeranno caselle acquatiche costiere. Questo potrebbe causare la distruzione dei miglioramenti e dei distretti costruiti nelle caselle allagate e la perdita di popolazione nei Centri cittadini.

Man mano che il livello di CO2 si innalza a livello globale, aumenta anche il rischio che si verifichino tempeste, inondazioni fluviali e siccità. Inoltre tali eventi saranno probabilmente più gravi di come sarebbero stati con livelli di CO2 inferiori. Ai livelli più alti di Cambiamento Climatico comincia a verificarsi una desertificazione: tempeste e inondazioni non aumentano più le rese, mentre gli aumenti alla fertilità ottenuti in precedenza (grazie a vulcani, inondazioni o tempeste) possono andare perduti in seguito a nuove tempeste o siccità.

Le centrali nucleari possono fornire Energia alle tue città senza causare un riscaldamento globale significativo, ma quando invecchiano aumenta la probabilità che si verifichi un incidente nucleare.

Dopo la sua costruzione una Centrale nucleare fornirà Energia senza problemi per un certo numero di turni. Man mano che invecchia, aumenterà la probabilità che si verifichi un incidente nucleare. Per proteggerti da questa eventualità puoi eseguire la manutenzione della centrale come progetto nella sua città.

Ci sono tre tipi di incidenti nucleari. Eccoli in ordine crescente di gravità: Perdita di vapore radioattivo, Perdita di radiazioni e Fusione del nocciolo. Quando si verifica un incidente, le caselle circostanti subiscono fallout radioattivo proprio come dopo l'esplosione di un ordigno nucleare. Inoltre è possibile che miglioramenti, edifici, unità e popolazione subiscano danni.

Le siccità sono periodi prolungati in cui le precipitazioni sono ridotte, a tal punto da rendere difficile o impossibile l'agricoltura e da provocare così una carenza di Cibo.

Una Siccità si può verificare in aree di prateria o pianura prive di caratteristiche come alberi o colline e senza fiumi o coste vicine. La Siccità sarà centrata su una particolare casella di prateria o pianura circondata da almeno quattro caselle di prateria o pianura che non contengono alcuna caratteristica. Una Siccità può anche estendersi ad altre caselle, arrivando potenzialmente a coinvolgere regioni vastissime. Le Siccità diventano più frequenti man mano che la temperatura globale aumenta.

Una Siccità riduce la resa di Cibo di una casella di 1. Inoltre eventuali fattorie, Campi, Piantagioni e Pascoli risulteranno saccheggiati, così come i miglioramenti Mekewap, Allevamento nell'Outback e Cahokia Mounds. Nei casi più severi, la Siccità potrà arrivare a distruggere completamente questi miglioramenti!

Una città dotata di un Acquedotto, una Diga, un distretto Terme o un miglioramento Pozzo a gradini non subisce la riduzione di -1 Cibo durante la Siccità, ma i suoi miglioramenti sono comunque saccheggiati.

Una Siccità grave dura per 5 turni, una Siccità estrema per 10. Finché la Siccità dura, i miglioramenti non possono essere riparati o ricostruiti. Quando finisce, una Siccità non offre alcun vantaggio.

Qualsiasi casella di bosco o foresta pluviale può prendere fuoco. Le fiamme divampano per tre turni, distruggendo i miglioramenti nella casella, riducendo la popolazione della città e danneggiando le unità. Nel secondo e terzo turno l'incendio può diffondersi nelle caselle adiacenti che contengono bosco o foresta pluviale.

Quando l'incendio si esaurisce il bosco o la foresta pluviale sono sostituiti dalla corrispondente variante bruciata, che incrementa la resa di Cibo della casella. Nel corso dei 3 turni successivi la vegetazione ricresce fino a tornare al suo stato normale: a questo punto aumenta anche la Produzione fornita dalla casella.

Uno sciame meteorico può manifestarsi in qualsiasi casella terrestre che non fa parte del territorio di alcun giocatore, lasciando un Meteorite nella casella colpita. Qualsiasi unità può raccoglierlo e impadronirsi dei metalli rari contenuti nelle rocce spaziali, il che farà acquisire al giocatore un'unità di Cavalleria pesante gratuita nella città più vicina. Quest'unità non ha alcun costo di mantenimento in risorse.

Gli effetti delle eruzioni solari si applicano all'intera mappa. Nel turno in cui si verificano, gli edifici Centrale elettrica sono distrutti. Inoltre è possibile che restino danneggiati gli edifici relativi all' Energia, i distretti Zona industriale, Campus e Spazioporto, le unità avanzate e i miglioramenti avanzati.

Gli impatti delle comete coinvolgono quattro caselle adiacenti o colpiscono i Centri cittadini, spazzando via tutto e rendendo le caselle invalicabili.