Франсиско де Паула Сантандер был соперником Симона Боливара — одновременно и союзником, и врагом Освободителя. По сей день он остается одним из величайших героев Колумбии. Он был одним из двух командующих во время важнейшей битвы при Бояке — ударе в самое сердце испанских сил в Колумбии. Чтобы застать испанцев врасплох, Сантандер вместе с Боливаром провел свои войска изнурительным маршем по разлившимся после дождей рекам и заснеженным горным перевалам. Победа колумбийцев в битве позволила Боливару заявить об окончательном освобождении Великой Колумбии.

Но союз двух полководцев грозили разрушить идеологические разногласия. Боливар выступал за пожизненные полномочия для правителей и взращивал вокруг себя культ личности. Сантандер же, которого впоследствии назвали «человеком закона», ратовал за правление в соответствии с конституцией. Когда Боливар объявил себя диктатором, Сантандер не смог с этим мириться, и их отношения еще более ухудшились. Он заработал себе немало врагов среди сторонников Боливара, но помимо них Сантандеру приходилось иметь дело с желающими разделить Великую Колумбию на более мелкие, независимые государства.

На Сантандера пало подозрение в организации заговора против Боливара, и он был изгнан из страны. Впрочем, Боливар смягчился, и спустя годы, когда Великая Колумбия распалась, Сантандеру было разрешено вернуться. Он стал президентом Новой Гренады, и по сей день он остается центральной фигурой в истории Колумбии — в первую очередь для тех, кто поддерживает верховенство закона и ограничение власти военных.