Великая Колумбия вела войны на обширных территориях. Нередко Боливар сам возглавлял военные походы на спорные земли — таковой была, например, «Славная кампания» по освобождению Венесуэлы. Но иногда республиканские (антироялистские) армии действовали почти без согласования с центром. Так было в случае Сантьяго Мариньо. Уроженец острова Маргарита, в наши дни принадлежащего Венесуэле, Мариньо попытался единолично освободить колонию от испанцев. Пока Боливар наступал с запада, Мариньо вторгся в Венесуэлу с востока. Оба заявляли, что преследуют одну и ту же цель, но ни один не хотел признавать главенства другого. Согласно одной байке, Мариньо, наряженный в парадный мундир, как-то похвастался своему атташе: «Антонио, я молод, богат, красив, в свои 25 лет я уже главнокомандующий. Чего же мне еще не хватает?» Его атташе ответил просто: «Благоразумия».

В конце концов Мариньо пришлось уступить, и Боливар поручил ему командование Венесуэльским фронтом. Двое продолжили сражаться вместе и даже были вместе арестованы одним их своих же генералов, Хосе Рибасом, который желал стать правителем западной части Великой Колумбии.

Несмотря на это, Мариньо всегда мечтал сам править Венесуэлой. После того как Хосе Антонио Паэс провозгласил независимость Венесуэлы, Мариньо, в свою очередь, заявил о создании собственного независимого «государства на востоке». Его молодое государство было быстро ликвидировано, а самому Мариньо пришлось бежать. Но неудача не ослабила его решимости: позже он возглавил попытку переворота, а впоследствии, когда враги Паэса свергли бывшего президента, Мариньо встретился с ним на поле боя и нанес ему поражение.