Wolne miasta to te, które opuściły swoje cywilizacje z powodu utraty lojalności. Nie są one miastami-państwami, ponieważ z chęcią przyłączają się do wielkich cywilizacji biorących udział w rozgrywce. Wolne miasto, jak każde inne miasto, ma wskaźnik lojalności, na który wpływa nacisk lojalnościowy innych cywilizacji. Musi utrzymać go na odpowiednim poziomie. Jeśli poziom lojalności wolnego miasta spadnie do 0, przyłączy się ono do cywilizacji, która miała na nie największy nacisk lojalnościowy od chwili, gdy stało się niezależne. Oznacza to, że cywilizacje biorą udział w wyścigu o względy wolnego miasta. Maksymalizowanie nacisku lojalnościowego zwiększy twoje szanse na nagromadzenie w wolnym mieście największej ilości lojalności i włączenie go do swojej cywilizacji.

Wolne miasta naprawiają splądrowane ulepszenia, tworzą jednostki, by się bronić, oraz mogą wznosić mury obronne. Zaatakowane przez cywilizację będą próbowały przeprowadzić atak odwetowy na jedno z miast agresora. Gdy nie są niepokojone, zajmują się własnymi sprawami i oczekują na wyłonienie się cywilizacji, która zdobędzie ich lojalność.