Chociaż królowa Himiko jest obecnie postacią z legend, to prawdopodobnie istniała naprawdę. Była królową Yamatai, królestwa leżącego na wyspach nazywanych przez Chińczyków Wa, stanowiących współcześnie terytorium Japonii. Z chińskich kronik wynika, że Himiko wysłała dary do królestwa Cao Wei – jednego z trzech państw oddzielających Chiny od Yamatai w III wieku n.e., wysuniętego najbardziej na północ. W zapiskach tych Himiko nazwana została przez cesarza Chin „królową Wa [Japonii] i przyjaciółką Wei”.
Szczególnie interesującą kwestią w historii Himiko są oskarżenia o czary. Chińskie źródła podają, że przymusiła wszystkich mieszkańców Wa do posłuszeństwa za pomocą czarów i że mieszkała w wielkim zamku obsługiwanym wyłącznie przez kobiety (w środku przebywał tylko jeden mężczyzna, podający Himiko jedzenie), który rzadko opuszczała. Tę mistyczną reputację potęgują japońskie przekazy, utożsamiające władczynię z wieloma boskimi istotami: najwyższą szamanką japońskiej bogini słońca Amaterasu lub szamanistyczną żoną boskiego węża. W tej ostatniej historii Himiko (określana mianem Yamato-toto-hi-momo-so-bime no Mikoto) jest szczęśliwą małżonką boskiego bytu, który odwiedza ją wyłącznie nocą. Błaga męża, aby pozostał z nią do rana, bo pragnie zobaczyć go w świetle słońca, ale ten jest nieustępliwy. W końcu jednak daje się przekonać i oznajmia, że kobieta zobaczy go rano w szkatule z przyborami toaletowymi, ale musi obiecać, że nie będzie zszokowana jego wyglądem. Gdy następnego ranka Himiko otwiera szkatułę, znajduje zwiniętego w środku pięknego białego węża. Na jego widok wydaje okrzyk zaskoczenia, wobec czego boski wąż znowu przybiera ludzką postać. Rozgniewany złamaniem obietnicy, mówi Himiko, że teraz musi ją porzucić. Ta zaś z żalu odbiera sobie życie.
Z wielu opowieści dotyczących Himiko wyłania się obraz niezwykłej kobiety. Łączyła w sobie cechy królowej i szamanki, co musiało niepokoić współczesnych jej – w dużej mierze patriarchalnych – kronikarzy. Jej historia stanowi dowód na to, jak wielką kontrolę nad nami mogą mieć charyzmatyczne osoby. We współczesnej Japonii Himiko bywa przestawiana jako uwodzicielka lub stara, mądra królowa, ale w każdej postaci pozostaje nieodmiennie popularna.