Una ciudad libre es una ciudad que ha abandonado su civilización original debido a una pérdida de Lealtad. No son ciudades-estado, ya que es muy probable que muestren interés por unirse a alguna de las grandes civilizaciones de la partida. Una ciudad libre también ha de mantener su Lealtad, al igual que una ciudad normal, por lo que las demás civilizaciones también pueden ejercer sobre ella presión por Lealtad. Si su Lealtad llega a 0, se anexionará a la civilización que haya ejercido más presión por Lealtad sobre ella desde que dicha ciudad libre se independizó. Esto quiere decir que si quieres que una ciudad libre se una a ti, primero deberás competir con las demás. Maximizar la presión por Lealtad hará que tengas más probabilidades de acumular una mayor cantidad de presión y, por ende, hacer que la ciudad se una a ti.

Para defenderse, una ciudad libre reparará sus mejoras saqueadas y entrenará unidades, además de poder erigir murallas. Si una civilización la ataca, la ciudad libre intentará tomar represalias contra una de las ciudades de dicha civilización, pero si reina la paz, los ciudadanos realizarán sus propias actividades mientras esperan a que una civilización del mundo les llame la atención.