Los Volcanes se suelen encontrar cerca de las fronteras entre continentes. Tienen tres estados: inactivos, activos o en erupción. Los Volcanes inactivos son idénticos a las casillas de montaña, pero es posible que uno de ellos pase a estar activo. Cuando eso ocurra, empezará a brillar por dentro y a expulsar humo, señal de lo que está por llegar. Los Volcanes activos acabarán entrando en erupción y dañando las casillas colindantes y los accidentes o mejoras de dichas casillas.

Las mejoras afectadas por un Volcán en erupción se pueden saquear o eliminar. Las Guarniciones y las Fortificaciones pueden sufrir daños. Los Centros urbanos cercanos a un Volcán en erupción pueden perder Población. Sin embargo, no todo es malo, ya que cada casilla afectada por una erupción volcánica tiene una posibilidad de aumentar sus Alimentos y Producción después de dicho evento. Las maravillas no se ven afectadas por las erupciones.

Las Fisuras geotérmicas son accidentes geográficos que no se pueden eliminar y que añaden +1 a Ciencia en la casilla. El Acueducto y las Termas romanas estándares otorgan +1 a Servicios si se construyen adyacentes a una Fisura geotérmica. Los Baños termales húngaros otorgan +2 a Servicios y +3 a Turismo . La mejora Central geotérmica debe construirse sobre una Fisura geotérmica.

Cualquier casilla adyacente a un Río puede sufrir una inundación. Estos sucesos pueden saquear o eliminar mejoras de casilla, saquear los edificios de los distritos, diezmar la población del Centro urbano y dañar unidades o fortificaciones. Las maravillas no se ven afectadas por las inundaciones. La gravedad de las inundaciones no es siempre la misma, y las más severas (como la milenaria) afectan a una zona más amplia. Puedes evitarlas construyendo una Presa a lo largo del cauce del río, aunque solamente puede construirse una por río. La maravilla Grandes baños también evita el daño causado por las inundaciones. Después de que estas ocurran, es posible que las casillas afectadas den más Alimentos o Producción .

Las Tormentas pueden aparecer en cualquier punto del mapa y durarán 3 turnos. Las fases de estos sucesos son Aparición, Movimiento y Desaparición. El tipo variará en función del terreno colindante, y todas ellas pueden dañar o eliminar mejoras de casilla, dañar los edificios de los distritos, reducir la población de los Centros urbanos o dañar las unidades. Los efectos de la Tormenta varían según el tipo:

Las Ventiscas solo pueden ocurrir en casillas de Nieve o de Tundra. Pueden ir de considerables (7 casillas) a devastadoras (19 casillas). Después de que pase una Ventisca, hay una probabilidad de que las casillas afectadas den más Alimentos .

Las Tormentas de arena solo pueden ocurrir en casillas de Desierto. Pueden ir de graduales (3 casillas) a haboob (7 casillas). Después de una Tormenta de arena, es posible que las casillas afectadas den más Alimentos o Producción .

Los Tornados solo pueden ocurrir en casillas de Llanura y Pradera. Pueden ir de una familia (1 casilla) a una oleada (3 casillas).

Los Huracanes solo pueden ocurrir en casillas de Océano. Pueden ir de categoría 4 (7 casillas) a categoría 5 (19 casillas). Después de un Huracán, es posible que las casillas afectadas den más Alimentos o Producción .

A medida que la partida avance por las distintas épocas, las civilizaciones descubrirán la Energía y los recursos consumibles. Usar recursos consumibles para conseguir energía producirá dióxido de carbono, y cuando este aumente provocará el deshielo de los polos y el aumento del nivel del mar.

El terreno costero se muestra en uno de estos cuatro niveles:
1 metro
2 metros
3 metros
Inmune a la inundación costera.

Cada nivel de dióxido de carbono global alcanzado aumenta el nivel del mar 0,5 metros. Así, en el nivel 2, el terreno costero que se encuentre a un metro quedará inundado. Si se alcanza un nivel lo bastante alto, las casillas de uno y dos metros quedarán sumergidas y se convertirán en casillas costeras, lo que podría provocar la destrucción de las mejoras y los distritos de las casillas inundadas, así como una pérdida de población en los Centros urbanos.

Conforme el dióxido de carbono global aumente, la probabilidad de que se produzcan Tormentas, Inundaciones fluviales y Sequías será mayor. Además, cuanto más dióxido de carbono haya, más peligrosos podrán ser estos sucesos. En los niveles más altos, empezará a producirse desertización por el cambio climático: las Tormentas y las Inundaciones ya nada producen a su paso y lo ganado anteriormente de fertilidad (por Volcanes, Inundaciones o Tormentas) se puede perder debido a Tormentas y Sequías.

Aunque las Centrales nucleares pueden dar Energía a las ciudades sin causar mucho calentamiento global, hay posibilidades de que ocurra un Accidente nuclear a medida que la Central nuclear envejezca.

Cuando se construye una Central nuclear, esta dará Energía sin más problema durante un número de turnos. A medida que envejezca, aumentarán las posibilidades de que ocurra un Accidente nuclear. Puedes protegerte de ello realizando el mantenimiento de la Central nuclear como un proyecto en la ciudad donde se encuentre.

Los Accidentes nucleares tienen tres niveles de gravedad (de menor a mayor): Emisión de gases radiactivos, Fuga de radiación y Fusión del núcleo. Cuando suceden, hay escapes de radiación y las casillas están sujetas a Lluvia radiactiva, como si hubiera detonado un arma atómica. También hay una posibilidad de que las mejoras, los edificios, las unidades y la población se vean afectados.

Las Sequías son periodos prolongados de precipitaciones reducidas o nulas en los que cultivar se hace más difícil o imposible, lo que supone una pérdida de Alimentos .

Las Sequías pueden darse en casillas de Llanura o Pradera que carezcan de accidentes como árboles o colinas o estén lejos de ríos o costas. Las Sequías se centrarán en una casilla de Pradera o Llanura que tenga al menos cuatro casillas de Pradera o Llanura adyacentes que no cuenten con ningún otro accidente. Una Sequía también se puede extender a más casillas, y puede acabar afectando a regiones enormes. Las Sequías se vuelven más comunes a medida que aumenta la temperatura global.

Una Sequía reducirá en 1 los Alimentos que produce una casilla. Además, todas las Granjas, Plantaciones, Pastizales y las mejoras Mekewap, Station del Outback y Túmulo de Cahokia construidas en las zonas afectadas se verán saqueadas. Hay incluso una posibilidad de que las Sequías más graves eliminen estas mejoras.

Una ciudad que cuente con un Acueducto, una Presa, un distrito de Termas o la mejora Pozo escalonado no sufrirá el -1 a la producción de Alimentos durante una Sequía, pero aun así verá las mejoras saqueadas por esta.

Una Sequía grave dura 5 turnos y una extrema, 10. Las mejoras no se pueden reconstruir ni sustituir mientras esté activa. Las Sequías no ofrecen beneficio alguno una vez terminan.

Cualquier casilla con Bosque o Selva tropical puede incendiarse. El fuego arde durante tres turnos, destruye las mejoras que haya en el hexágono, reduce la población de la ciudad pertinente y daña a las unidades. En el segundo y tercer turnos, este fuego puede extenderse a cualquier casilla adyacente de Bosque o Selva tropical.

Una vez que se haya extinguido el incendio, el Bosque o la Selva tropical se reemplazan con una variante Quemada, lo que aumenta el rendimiento de Alimentos de la casilla. Durante los 3 turnos siguientes, rebrota hasta llegar a su estado normal, momento en el que también aumenta el rendimiento de la Producción .

Los meteoritos pueden caer en cualquier parte del espacio entre los territorios del jugador y dejan un Cráter de meteorito. Cualquier unidad puede recolectar en él los minerales avanzados de fácil acceso en las rocas caídas, lo cual le dará gratis una unidad de Caballería pesada en la ciudad que tenga más cerca. Esta unidad no tiene coste de mantenimiento en recursos.

Las erupciones solares afectan a todo el mapa. Durante el turno en el que surgen destruyen Plantas eléctricas y pueden dañar unidades avanzadas y mejoras, edificios relacionados con la Energía y los distritos de Campus, Zonas industriales y Puertos espaciales.

Las caídas de cometas afectan a cuatro casillas adyacentes o Centros urbanos objetivo, eliminan cualquier cosa que encuentren en el camino y hacen la casilla infranqueable.