Na configuração de partida, os jogadores podem ativar o modo de jogo Apocalipse, alterando a gravidade dos desastres, introduzindo uma nova Competição Pontuada e unidade, e testemunhando o fim do mundo, com os planetas e civilizações atingidos por cometas.

O modo de jogo Apocalipse introduz uma nova unidade, o Vidente. Essa unidade tem a habilidade exclusiva de causar desastres naturais: leve-o para um local adequado e use a ação Causar Desastre para iniciar uma inundação, tempestade, incêndio ou erupção vulcânica nos painéis próximos. Isso gera uma pequena quantia de CO2 que acelera as mudanças climáticas.

Videntes só podem ser comprados com fé e podem ser escoltados. A cada promoção, eles ganham mais cargas para causar desastres. Videntes não ganham experiência; em vez disso, eles desbloqueiam novas promoções por meio de uma nova Competição Pontuada.

Para ganhar promoções para seus Videntes, você terá de participar da competição pontuada Acalmar os Deuses. Ela aparecerá durante o jogo, dando-lhe a capacidade de usar seus Videntes para sacrificar suas unidades de combate perto de vulcões e ganhar pontos. Jogadores com altas pontuações ganham promoções para todos os seus Videntes atuais e futuros. Sacrificar as unidades gera uma pequena quantia de CO2 que acelera as mudanças climáticas.

Dois novos desastres são exclusivos do modo de jogo Apocalipse:
Erupções Solares: ao redor do mundo, a radiação solar bombardeia o planeta, causando dano a edificações e melhorias de energia, pilhando certos distritos e causando dano a unidades de final de jogo
Colisões de Cometa: um cometa cai no planeta destruindo tudo em seu caminho, até mesmo cidades

Desastres terríveis e de alto dano, especialmente Colisões de Cometa, ficam mais frequentes depois que a Mudança Climática atinge seu nível máximo. Nesse momento, os jogadores terão que vencer rapidamente, ou o fim do mundo decidirá o vencedor por eles.