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Depuis Aristote, la philosophie naturelle, première "science" systématique, consiste en l'étude du monde physique. Biologie, physique, chimie, astronomie, mathématiques et tant d'autres, toutes les sciences trouvent leurs racines dans la philosophie naturelle. La plupart des successeurs d'Aristote, comme Parménide, Héraclite ou encore Démocrite, s'intéressèrent à l'ordre naturel. Consignée dans le Corpus aristotélicien, ou du moins ce qu'il en reste, la conception aristotélicienne des lois régissant le monde prévalut jusqu'au Moyen-âge. Si l'étude empirique et la compréhension du monde se sont divisées en plusieurs disciplines, elles trouvent toutes leur source dans la philosophie naturelle. Aujourd'hui, les frontières entre les disciplines deviennent à nouveau de plus en plus floues.