流經馬斯喀特的貿易人潮，至少兩千年來都是其命脈所在。座落於哈迦山脈的丘陵旁，托勒密早在西元1世紀便稱其為隱藏之港（Cryptus Portus）。不幸的是，這個城市始終無法隱藏，在波斯灣海口的絕佳位置讓他成為無數征服者垂涎的目標。

在數個世紀間，馬斯喀特港上飄揚的旗幟已易主多次：薩珊王朝、阿拉伯王朝（在他們的統治下，馬斯喀特於7世紀皈依了伊斯蘭教）、阿拔斯王朝、塞爾柱帝國以及波斯王朝等等。在16世紀前期，一位葡萄牙海軍上將挾帶著重炮，企圖建立貿易關係，並將馬斯喀特幾乎摧毀殆盡。其後馬斯喀特便在葡萄牙的統治下進行重建，直到1650年阿曼人逼走葡萄牙人，重新奪回這個海港城市為止。

馬斯喀特時常因為自治議題與其他阿曼的內部部落有所衝突。在18世紀的一個動盪時期中，賽義德王朝於此誕生，自此再未經歷過任何戰火摧殘。時值今日，經過現代化翻新的馬斯喀特仍是阿曼的首都與重要貿易港。