索馬利亞的海岸自古便是貿易要衝。而現在若考慮到通過蘇伊士運河及印度次大陸的貿易路線，此地區之重要性不言自明。在羅馬帝國時代，索馬利亞和阿拉伯商人並不鼓勵印度商人造訪非洲之角的北部港口，因為這些港口太過接近羅馬人的市集（同時也是為了自行保有這有利可圖的人脈），但他們卻鼓勵印度商人在摩加迪休自由發展勢力，因此這座城市很快便成為印度商人在非洲的大本營。除了和印度與羅馬貿易外，索馬利亞商人還負責將腓尼基、埃及、希臘、波斯等地的布料等商品送往斯瓦希里海岸的另一端。但其貿易網路同時也向西延展至蘇丹及衣索比亞。14世紀的阿拉伯哲學家伊本·赫勒敦曾將摩加迪休形容為繁華的都市，同時卻在本質上保有著遊牧民族的風範——赫勒敦曾提出遊牧民族和定居民族間在歷史上有著互相保持緊張關係的循環，而摩加迪休便代表著遊牧民族的勝利。

當後知後覺的義大利人決定加入其他歐洲列強的行列，追求殖民主義的成功時，他們將目光放到了非洲之角上。19世紀末，英國人將厄利垂亞（意為拉丁文的「紅海」）「贈與」給義大利人，而義大利人則嘗試過征服衣索比亞（但卻在衣索比亞皇帝孟尼利克二世的阻撓下失敗），還讓索馬利亞蘇丹簽署了成為義大利保衛國的條約，於是摩加迪休變短暫地成為了義大利之屬地，但到了1940年代，義屬索馬利亞在英軍的攻勢下淪陷，而英國之後則將此地區交由聯合國託管，直到索馬利亞於1960建國為止。索馬利亞獨立建國後，摩加迪休變成了其首都。