火山通常位于大陆边缘。火山分为三类状态：休眠、活跃与喷发。休眠火山与山脉单元格相同。但休眠火山可能会转为活跃。一旦进入活跃状态后，其内部将开始闪烁火光，山顶冒出的滚滚浓烟则暗示着即将发生的事情。活跃火山最终会开始喷发，对周围的单元格及其中的地貌和改良设施造成损害。

火山喷发将掠夺或移除受影响的改良设施。其还会对驻军和防御工事造成伤害。喷发火山旁的市中心人口可能会有所下降。塞翁失马焉知非福，喷发结束后，受影响的所有单元格有一定几率提高 食物和 生产力的产出。奇观不受喷发影响。

地热裂缝是一种无法清除的地貌特征，其为单元格+1 科技值。建造在地热裂缝旁的标准水渠和罗马浴场+1 宜居度。若为匈牙利温泉浴场，则+2 宜居度、+3 旅游业绩。地热发电厂改良设施必须建造在地热裂缝上。

洪水可能会在相邻江河的任何单元格中泛滥。其有几率掠夺或移除改良设施、掠夺区域中的建筑、减少市中心人口，并造成单位或防御工事的损伤。奇观不受洪水的影响。洪水的等级各不相同，等级越高（例如千年难遇洪水）影响的范围便越大。沿河岸建造堤坝可防止江河泛滥；每条河流旁仅能建造1座堤坝。“大浴场”奇观可防止洪水造成伤害。洪水过后受影响单元格有几率提升 食物或 生产力的产出。

风暴可能出现在地图中的任何地方，持续3回合。风暴分为形成、移动、消散3个阶段。而风暴类型则视周围地貌而定。所有类型的风暴都有一定几率掠夺或移除单元格中的改良设施、掠夺区域中的建筑、减少市中心人口，同时对单位造成伤害。不同类型的风暴带来的影响也有所不同：

暴风雪仅会发生在雪地或冻土单元格中。其强度由“严重性”（7个单元格）到“灾难性”（19个单元格）。暴风雪经过后，受影响的单元格有一定几率提高 食物产出。

沙尘暴仅会发生在沙漠单元格中。其强度由“梯度”级（3个单元格）到“哈布”级（7个单元格）。沙尘暴经过后，受影响的单元格有一定几率提高 食物或 生产力收益。

龙卷风仅会发生在平原和草原单元格中。其强度由“多漩涡”级（1个单元格）到“爆发”级（3个单元格）。

飓风仅会发生在海洋单元格中。其强度“4级”（7个单元格）及“5级”（19个单元格）。飓风经过后，受影响的单元格有一定几率提高 食物或 生产力的产出。

随着游戏时代的发展，文明将会发现电力与消耗性资源。使用消耗性资源进行发电会产生二氧化碳。随着二氧化碳浓度的提升，极地冰盖将会逐渐融化，造成海平面的升高。

在游戏中，海岸地貌将会显示为以下4种等级：
1米
2米
3米
无海岸洪水影响。

每达到一个全球性二氧化碳浓度标准，海平面将提升0.5米。这意味着，1米到2米的海岸地貌将会被洪水淹没。若达到一定高度，1米和2米的单元格将会沉入海中，成为海岸水域单元格。受灾单元格中的改良设施与区域将被摧毁，同时市中心的人口也将随之下降。

随着全球二氧化碳升高，风暴、江河泛滥和干旱的出现几率也会升高。此外，这些灾害将比二氧化碳排放量低时更为严重。气候变化最高峰时将出现荒漠化：风暴和洪水将不再提供产出，之前曾有的肥沃度收获（来自火山喷发、洪水或风暴）可能被风暴和干旱所摧毁。

虽然核电站可以在不造成明显全球变暖的前提下为城市提供 电力，但随着核电设施的老化，便存在发生核事故的可能性。

核电站建成后，其可安全地提供一定回合数的 电力。而随着设施的老化，核事故发生的几率将会增加。在核电站所在城市中开展维护核电站的项目可以降低此类事故发生的风险。

核事故按照严重性分为以下三个等级：放射性蒸汽溢出、辐射泄漏与核芯融毁。发生以上情况时，辐射泄露会使单元格布满放射性尘埃，效果如同核武器爆炸。受影响的改良设施、建筑、单位与人口有几率遭受伤害。

降水量长期减少会引发干旱，使农作物生长困难甚至颗粒无收，从而引发 食物短缺。

在缺少树木丘陵、或远离河流海岸等地貌的草原或平原地区有可能发生干旱。干旱将以草原或平原单元格为中心，周围则有至少4个与之相邻且无其他地貌的草原或平原单元格。干旱可能蔓延至其他单元格，有可能影响大片地区。随着全球变暖加剧，干旱将愈发常见。

干旱会使单元格减少1点 食物产出。此外，修建在受影响区域中的所有农场、营地、种植园、牧场、棚屋、内陆牧场和卡霍基亚土墩改良设施将被掠夺。发生最严重的干旱时，这些改良设施有可能被完全移除！

拥有水渠、堤坝、浴场区域或梯井改良设施的城市在干旱中不会蒙受 食物产出-1的减益，但其改良设施仍会遭到掠夺。

大型干旱可持续5回合，而极端干旱将持续10回合。干旱发生期间无法重建或替换改良设施。干旱结束后不会带来任何加成。

树林和雨林单元格均可能起火。林火持续3回合，将摧毁单元格上的改良设施、减少所在城市的人口，并伤害单位。在第二回合和第三回合，林火可能蔓延到相邻的树林和雨林单元格。

林火熄灭后，树林或雨林将呈现“烧焦”效果，提升单元格的 食物产出。在之后的三回合中，其将重新生长，直到恢复为正常状态。回归正常状态后单元格的 生产力产出将提升。

流星雨可能降落在玩家领土之间的任意处，并形成“流星坑”。任意单位到达此处后，便能从天外流星中轻松获得高级矿石，从而在最近的城市中免费获得1个重骑兵单位。此单位无资源维护花费。

太阳耀斑会影响整个地图。在触发的回合中，其将破坏 发电厂，还可能损伤高级单位和改良设施、 电力相关的建筑，以及学院、工业区和宇航中心区域。

彗星撞击将影响4个相邻的单元格或目标市中心，将移除撞击处单元格上的一切，并使这些单元格变为不可通行。