Las Emergencias se activan en respuesta a una acción grave realizada por una civilización, como la conquista de una ciudad-estado, la conversión de una ciudad santa o un ataque nuclear. El resto de civilizaciones en la partida podrán unirse contra el jugador que ha activado la Emergencia. Las civilizaciones que sean amigas declaradas o aliadas de la civilización objetivo solo podrán unirse en el caso de Emergencias de traición.

Las civilizaciones que se unan tendrán que cumplir un objetivo concreto dentro de un límite de tiempo. Los miembros del grupo pueden obtener bonificaciones de ayuda para cumplir su objetivo. Si lo cumplen, todos los miembros que hayan participado en la Emergencia recibirán una recompensa especial, pero si se les acaba el tiempo antes de conseguirlo, recibirán una penalización y será el objetivo quien reciba las recompensas.

Estas son las Emergencias del juego:

Emergencia militar: una civilización que va en cabeza de algún tipo de victoria acaba de capturar una ciudad de otra civilización. Los miembros deben capturar ciudades del objetivo, y para ello, reciben una bonificación de Movimiento en el territorio del objetivo y comparten entre sí Paz, Apertura de fronteras y Visibilidad compartida. Todos los miembros irán a la guerra contra el objetivo, y este verá su Fuerza reducida al enfrentarse a ellos. Si los miembros tienen éxito, recibirán una bonificación de curación en el territorio del objetivo en el futuro. Sin embargo, si no consiguen capturar suficientes ciudades para cuando acabe la Emergencia, el objetivo se alzará con la victoria y recibirá una bonificación permanente a la Fuerza del ataque a distancia de su ciudad.

Emergencia de ciudad-estado: una civilización ha capturado y está ocupando una ciudad-estado. Los miembros deben liberar la ciudad-estado, y para ello, todos librarán una guerra contra el objetivo y compartirán entre sí Paz, Apertura de fronteras y Visibilidad compartida. Si los miembros consiguen liberar la ciudad-estado, recibirán Oro por turno por cada Enviado que tengan allí, pero si el objetivo reafirma su control en la ciudad-estado, se hará con la victoria y recibirá Oro por turno por cada Ruta comercial que tenga allí.

Emergencia religiosa: una civilización ha propagado su religión para conquistar la ciudad santa de otra religión. Para superar la Emergencia, los miembros deben hacer que la ciudad santa reniegue de la religión recién adoptada durante cierto número de turnos y, si lo consiguen, cada miembro recibirá una reliquia. Por su parte, la civilización objetivo ganará si los miembros de la Emergencia son incapaces de hacer que la ciudad santa reniegue de su nueva religión durante el número adecuado de turnos antes de que finalice la Emergencia, en cuyo caso esa nueva religión tendrá una mayor presencia.

Emergencia nuclear: una civilización ha empleado un arma nuclear en una ciudad. Los miembros deben capturar ciudades del objetivo, para lo que reciben una bonificación de Movimiento en el territorio del objetivo, así como Paz, Apertura de fronteras y Visibilidad compartida entre ellos. Todos los miembros irán a la guerra contra el objetivo, que verá que su Fuerza se reduce al enfrentarse a ellos. Si los miembros tienen éxito, la Fuerza de las unidades militares del objetivo se reducirá aún más y de manera permanente al luchar contra los miembros de la Emergencia. Si fracasan, sin embargo, la Lealtad de todas las ciudades de los miembros se reducirá.

Emergencia de traición: una civilización le ha declarado la guerra a otra civilización con la que tenía una alianza de gran nivel. Los miembros deben capturar ciudades del objetivo. Para ello, tendrán una bonificación de Movimiento en el territorio del objetivo y compartirán entre sí Paz, Apertura de fronteras y Visibilidad compartida. Todos los miembros librarán una guerra contra el objetivo, y este sufrirá una penalización de Fuerza al luchar contra ellos. Además, las Rutas comerciales que los miembros tengan con el objetivo se cancelarán, mientras que las que los miembros tengan entre sí obtendrán una bonificación a la Producción . Si los miembros ganan, las unidades militares del objetivo sufrirán una penalización permanente de Fuerza al luchar contra los miembros, pero si estos no consiguen capturar suficientes ciudades para cuando acabe la Emergencia, el objetivo saldrá victorioso y obtendrá una reducción permanente de hastío bélico al luchar contra los miembros.

La capacidad de una civilización para participar en una Emergencia se determina en función de sus relaciones diplomáticas con otras civilizaciones y ciudades-estado del juego.