桑卡雷大學坐落於廷巴克圖的桑卡雷金字塔清真寺之中以及週邊。其在古代,特別是曼薩·穆薩統治時期,是一座名聲極為顯赫的高級教育中心。
桑卡雷大學與現代的大學運作方式極為不同。大學中並無中央行政部門,取而代之的是數個獨立的學校結成的組織,各自都有自己專屬的教授,而教學地點一般都選在庭院或是私人家中。對於現代的學生而言,這所大學似乎看起來有點隨興,但是桑卡雷大學在當時卻是聲名顯赫的伊斯蘭學習中心。課程內容自然包含了古蘭經教義的研究,但同時學生們也會學到像是醫學、地理、物理、歷史和藝術等世俗知識。桑卡雷大學總共提供四個等級的學位,並會為畢業的學生舉辦典禮。畢業生們將會戴上傳統的頭巾參加儀式,而頭巾則代表了他們各自在學業上取得的卓越成就。
西元1590年代,馬利遭到了摩洛哥的入侵,造成大量學者的流失,他們有些被驅逐出境,而另一些則選擇了逃亡,同時桑卡雷大學的大部分教學成果與著作也毀於一旦。