桑科雷大学坐落于廷巴克图的桑科雷金字塔清真寺之中。其在古代,特别是曼沙·穆萨统治时期,是一个非常优秀的学习中心。
桑科雷大学与现代的大学运行方式极为不同。大学中并无中央行政部门,取而代之的是数个独立的学校结成的组织,其各自都有自己专属的教授,而教学地点一般都选在庭院或是私人家中。对于现代的学生而言,这所大学似乎看起来过于随意,但是桑科雷大学在当时却是声名显赫的伊斯兰学习中心。学习课程自然包含了古兰经教义的讲习,但同时学生们也会汲取到像是医学、地理、物理、历史和艺术等世俗知识。桑科雷大学总共提供四个等级的学位,并会为毕业的学生举办典礼。毕业生们将会戴上传统的头巾参加仪式,而头巾则代表了他们各自在学业上取得的卓越成就。
公元1590年代,马里遭到了摩洛哥的入侵。这场战争造成大量学者的流失,他们中有人被驱逐出境,而另一些则选择了逃亡,同时桑科雷大学的大部分教学成果与著作也被毁于一旦。