據說，一場小革命就能夠帶來巨大的福音，16世紀宗教改革所帶來的變革十分深遠。這場革命的起因是一位德國神學家馬丁•路德抗議天主教會允許富人捐錢贖罪的大赦政策。他的理念在抗議者中廣為流傳，遍及歐洲各地，逐漸導致教會的宗教分裂。很快，路德教教義傳遍神聖羅馬帝國，改革宗教會在瑞士和荷蘭成立，長老會在蘇格蘭成立。（與此同時，英格蘭國王亨利八世創立安立甘會，和妻子離婚並迎娶少女安妮•博林。）

隨著人文主義和科學革命挑戰公認的「聖」經，天主教義開始衰弱。此外，自由思想在蓬勃發展的城市和新興的（和堅定的）中產階級中廣泛蔓延。正如經常發生的那樣，宗教改革運動伴隨著流血衝突；三十年戰爭徹底摧毀了德國，造成該國大約25％到40％的人口死亡，這是因為神聖羅馬帝國試圖重申天主教義。1648年簽訂的《威斯特伐利亞和約》最終結束了戰爭，和約確保每個主權國家都有權自行決定本國宗教，生活在各地的基督徒有權在公共場所遵循自己的信仰（即，在指定的時間裡）。

宗教改革可不只專屬於基督教。伊斯蘭教和猶太教的改革運動讓原本的信仰產生了新的分支。在這些運動中，改革者們嘗試讓傳統的「教會」順應自由主義和人權導向的價值觀。這些運動因對核心價值觀的解讀不同而產生，並強調宗教義務與實踐不斷演進的本質。佛教和印度教也演化出相似的運動，藉此可看出這些上古宗教試圖在現代文明中尋求關聯性之努力。