一旦文明创造了组织有序的宗教，就必然会有神学家出现。神学是“与宗教思辨和护教学有关的哲学学科”，其重点在于神学家、神圣纪事、人类、“神”、救赎论和末世论。它努力变得像科学一样适用且系统化时，产生了一系列的“论”：不可知论、无神论、自然神论、二元论、一神论、泛神论、多神论、万物有灵论，图腾论等各种理论。虽然神学肯定适用于一切宗教，但它一直是亚伯拉罕信仰如犹太教、基督教、伊斯兰教及其分支中的重要思想。

哲学家柏拉图用虚构的方法定义了“神学”一词，这可能具有暂时的教育意义但最终会被清除出理性状态。带有神话色彩的神学认同在整个地中海文明中十分普遍，直到基督徒生气了并宣称神学是宣扬神、向神忏悔并劝诫忏悔的一种手段。因此，在早期的中世纪之前，神学是其信徒的一种尝试，用来对信仰做出有逻辑性且合理的阐述，并按照理性主义来解释这种阐述，以及把神学放在“真实”世界和精神世界的背景之下。到了文艺复兴时期，神学家们竭尽全力远离神秘主义，并让自己受到其他学科的重视。

在中世纪晚期和文艺复兴早期，神学是多数大学里的基本学科，被称为“科学界的女皇”，同时还是三学科（文法，逻辑，修辞）和四学科（算术、几何、天文、音乐）的发展顶点，人们认为博学的年轻人都应该掌握这门学问。神学在大学课程中的卓越地位最终在启蒙运动中受到挑战，尤其是在德国。自此，大多悬而未决的争论都集中于神学方法是否具有适当的理论性和科学性。