Quando a civilização criou a religião organizada, era óbvio que teólogos surgiriam. A teologia é a "disciplina filosófica que trata da especulação religiosa e apologética", com foco no divino e no sagrado, na humanidade e "deus", na salvação e escatologia (destino final do ser humano). Em sua tentativa de ser aplicável e sistemática como qualquer ciência, a teologia deu origem a uma série de "ismos": agnosticismo, ateísmo, deísmo, dualismo, monoteísmo, panteísmo, politeísmo, animismo, totemismo e assim por diante. Embora certamente aplicável a todas as religiões, a teologia tem sido um assunto relevante principalmente nas religiões abraâmicas: judaísmo, cristianismo, islamismo e suas vertentes.

O filósofo Platão identificava o termo "teologia" com o mítico, que teria um sentido pedagógico temporário e que seria finalmente expurgado do estado racional. Essa identificação da teologia com a mitologia continuou comum nas civilizações do Mediterrâneo até que os cristãos ficaram ressentidos e declararam que a teologia era um meio de proclamar o divino, de confessar a ele e de pregar esta confissão. Assim a teologia no início da era medieval era uma tentativa de seus adeptos de realizar uma declaração de fé lógica e razoável, de explicar esta declaração em termos racionais e de colocá-la no contexto do mundo "real" e do espiritual. Com o Renascimento, teólogos estavam lutando para se distanciaram do misticismo e para serem levados a sério por outras disciplinas acadêmicas.

Durante o final da Idade Média e no início do Renascimento, a teologia era a disciplina suprema na maioria das universidades, sendo rotulada a "Rainha das Ciências" e servindo como a etapa final do trívio e do quadrívio que jovens moços educados tinham que dominar. A eminente posição da teologia no currículo universitário finalmente começou a ser contestada durante o Iluminismo, especialmente na Alemanha. A maioria dos debates ainda em curso tenta determinar se os métodos da teologia são adequadamente teóricos e científicos.