核攻击或核事故发生后，放射性尘埃会污染每个受爆炸或事故影响的单元格。在受污染单元格上结束回合的任何单位每回合将受到50点伤害。被污染单元格中的所有内容都无法使用 生产力，如修复建筑或区域。城市无法改良受污染的单元格，只有等待污染倒计时结束或单元格被“清理”干净。

建造者和军事工程师单位可“清除”受影响单元格上的核污染。清理被污染的单元格需要花费1个建造次数。能清理受污染格位的建造者和军事工程师单位在这样的格位上结束回合时，会受到较少伤害。未直接受到核污染影响的城市单元格仍将正常运转，并为城市带来收益。